More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0396 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  702    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  79.71 
 
 
351 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.61 
 
 
348 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 
381 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  36.9 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1454  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.69 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
362 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 
362 aa  193  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.25 
 
 
368 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
340 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
342 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.62 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.22 
 
 
341 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.91 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.91 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.91 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.91 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.91 
 
 
357 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.91 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1391  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
362 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 
336 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.09 
 
 
341 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.02 
 
 
341 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
342 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
343 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.82 
 
 
344 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.82 
 
 
344 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
344 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3153  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
375 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
351 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.63 
 
 
342 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
342 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
344 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4689  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.98 
 
 
370 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5074  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
370 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4775  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
370 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142879  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
336 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
337 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
344 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
359 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
344 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
343 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
350 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.52 
 
 
361 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.32 
 
 
342 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
342 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 
342 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
338 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13103  zinc-type alcohol dehydrogenase adhD (aldehyde reductase)  32.8 
 
 
368 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.256708  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5270  alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.1 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.51 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 
343 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
344 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1486  alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
370 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.25 
 
 
375 aa  162  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
361 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.02 
 
 
370 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.95 
 
 
336 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
350 aa  161  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
342 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.99 
 
 
340 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
346 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
344 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
337 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
344 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
362 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
366 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
341 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.25 
 
 
368 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
348 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10776  zinc-type alcohol dehydrogenase NAD dependent adhB  30.32 
 
 
375 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
358 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.28 
 
 
357 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5164  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
376 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
341 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
340 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  33.24 
 
 
361 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
349 aa  155  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
335 aa  155  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>