More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03027 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04078    99.38 
 
 
486 bp  940    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.532563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  99.18 
 
 
546 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03281    99.18 
 
 
546 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02780    98.56 
 
 
759 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01537    98.56 
 
 
807 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  96.91 
 
 
846 bp  844    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  99.38 
 
 
546 bp  940    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  95.47 
 
 
846 bp  789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03666    98.97 
 
 
816 bp  924    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  99.38 
 
 
846 bp  940    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02557    93.42 
 
 
546 bp  710    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.141347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01848    99.3 
 
 
786 bp  815    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  92.59 
 
 
846 bp  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  98.97 
 
 
846 bp  924    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  98.96 
 
 
648 bp  918    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  97.74 
 
 
846 bp  876    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  92.59 
 
 
846 bp  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02902    99.06 
 
 
786 bp  807    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02741    98.48 
 
 
783 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03027    100 
 
 
486 bp  963    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  98.56 
 
 
546 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  92.59 
 
 
846 bp  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02481    97.12 
 
 
546 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  95.68 
 
 
846 bp  797    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  93.21 
 
 
846 bp  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  92.59 
 
 
846 bp  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  99.06 
 
 
426 bp  807    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  96.29 
 
 
846 bp  819    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03796    99.59 
 
 
546 bp  948    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  99.38 
 
 
546 bp  940    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  98.26 
 
 
345 bp  636  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01935    98.26 
 
 
345 bp  636  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  93.91 
 
 
486 bp  632  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04015    93.92 
 
 
783 bp  617  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01970    93.43 
 
 
483 bp  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00429349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  90.16 
 
 
318 bp  359  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01542    99.42 
 
 
531 bp  325  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  99.42 
 
 
774 bp  325  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03626  transposase  94.03 
 
 
261 bp  303  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01967  hypothetical protein  96.27 
 
 
177 bp  272  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00113705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04084  transposase  95.71 
 
 
189 bp  268  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  85.19 
 
 
726 bp  153  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  89.9 
 
 
525 bp  117  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06071  hypothetical protein  83.44 
 
 
153 bp  101  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000238021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00856  hypothetical protein  83.44 
 
 
153 bp  101  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00434915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1279  putative transposase  84.34 
 
 
264 bp  61.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0690484  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
723 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0736  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1523  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1542  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1793  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1818  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.961912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1837  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00170274  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1940  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>