178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01162 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05698  IS66 family element, Orf1 protein  100 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0455822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01162  transposase  100 
 
 		 41 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  97.56 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01543  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02742  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00733  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01847  ISXoo3 transposase ORF A  97.56 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  100 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  100 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  100 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03279  ISXoo3 transposase ORF A  95.12 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  97.44 
 
 		 257 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00237  transposase  80.49 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1303  transposase IS3/IS911  65.85 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2424  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01379  hypothetical protein  92 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  56.1 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  65.71 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0108  transposase IS3/IS911  51.22 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2022  transposase IS3/IS911  51.22 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2784  transposase IS3/IS911  51.22 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  62.16 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0079  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0278085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  53.66 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0233  hypothetical protein  46.34 
 
 		 41 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28760  hypothetical protein  80 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000174621  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  48.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  48.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  48.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2172  putative transposase  57.5 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0137  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1300  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.66583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1483  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2820  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  55.88 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  55.88 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  55.88 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  52.94 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1332  putative transposase IS3/IS911  64.71 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  53.66 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  52.94 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  52.94 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  50 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03180  hypothetical protein  84 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  51.22 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  51.22 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  51.22 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2513  hypothetical protein  84 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3289  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>