17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5437 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  66.51 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  52.94 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0455  hypothetical protein  45.05 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2571  hypothetical protein  32.59 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2578  hypothetical protein  32.59 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2564  hypothetical protein  32.59 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00349718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3045  hypothetical protein  75.32 
 
 		 97 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242698  normal  0.16466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  42.28 
 
 		 421 aa  118  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0700  hypothetical protein  29.25 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  28.3 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  31.62 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0114  hypothetical protein  26.55 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1027  hypothetical protein  28.75 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  27 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  28.07 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>