15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4989 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  969    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  87.63 
 
 		 469 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  71.24 
 
 		 485 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  66.31 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  67.58 
 
 		 476 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  68.88 
 
 		 467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  66.38 
 
 		 473 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  68.03 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  67.96 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  59.57 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  56.6 
 
 		 487 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0845  LmbE family protein  31.3 
 
 		 445 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  30.6 
 
 		 322 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  28.21 
 
 		 316 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  27.39 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>