13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4835 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  75 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  48.08 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  48.08 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  46.79 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  51.92 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  46.79 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  46.67 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  41.11 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  30.28 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  34.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  38.61 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  34.52 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
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