43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4668 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  85.91 
 
 		 220 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  56.54 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  58.53 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  58.06 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  58.06 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  58.18 
 
 		 253 aa  237  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  45.33 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  47.69 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12700  hypothetical protein  47.71 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0916578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  26.64 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  26.64 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  27.9 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  26.2 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  26.96 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  25.76 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  26.07 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  25.22 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  25.22 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  26.09 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  25.22 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3497  hypothetical protein  25.44 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000878688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  24.24 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01239  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2372  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01229  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1364  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2393  protein of unknown function UPF0259  30.34 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00644905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1877  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00001512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1413  hypothetical protein  29.78 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.192697  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0441  membrane protein  21.1 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1861  hypothetical protein  26.02 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1924  hypothetical protein  26.02 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1412  hypothetical protein  26.02 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.787331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1594  hypothetical protein  26.02 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.694906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1867  hypothetical protein  26.02 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23026  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0288  hypothetical protein  27.11 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2324  hypothetical protein  27.66 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.830896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2050  hypothetical protein  27.66 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1942  hypothetical protein  27.66 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2284  hypothetical protein  29.81 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.288365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>