74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3786 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  100 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  96.17 
 
 		 235 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  53.48 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  49.13 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  46.46 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  46.02 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  42.48 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  44.84 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  41.15 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  42.73 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  41.56 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  42.04 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  42.04 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  42.04 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  42.04 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  42.04 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  42.48 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  40 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  41.56 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  40.69 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  42.48 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  42.04 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  41.59 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  41.59 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  41.81 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  39.82 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  38.84 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  41.03 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  39.38 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  39.39 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  40.89 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  39.56 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  39.11 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  39.11 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  39.11 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  39.11 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  39.11 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  39.11 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  38.67 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  37.78 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  37.33 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  37.33 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  37.33 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  31.3 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  34.63 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  35.04 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  32.91 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1604  phage shock protein A, PspA  32.89 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  28.69 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  28.1 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  28.21 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  30.59 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  27.83 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  27.9 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4514  phage shock protein A, PspA  31.17 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0564095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  31.56 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  27.43 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  28.89 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  26.29 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  29.29 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  26.29 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  26.92 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.38 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  33.15 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  25.64 
 
 		 283 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  29.61 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  27.45 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  21.86 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1863  phage shock protein A, PspA  27.78 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00208754 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  26.18 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1582  phage shock protein A, PspA  29.3 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  31.77 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>