18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3312 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3312  general secretion pathway protein J, putative  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3146  general secretion pathway protein J, putative  92.38 
 
 		 210 aa  342  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0625404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2178  general secretion pathway protein J, putative  50 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02681  general secretion pathway protein J  34.74 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0551  general secretion pathway protein J  33.81 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.094871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1119  general secretory pathway protein J  31.16 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0861  general secretion pathway protein J  30.56 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0604467  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0774  general secretion pathway protein J  30.56 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.532398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0683  general secretion pathway protein J  27.7 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0756  general secretion pathway protein J  26.51 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1304  general secretion pathway protein J  30 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2094  hypothetical protein  29.1 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0462903  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4155  general secretion pathway protein J  29.76 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.220352  hitchhiker  0.000742504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3004  putative general secretion pathway protein J  27.67 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2616  putative general secretion pathway protein J  28.43 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  34.78 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>