17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3146 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3146  general secretion pathway protein J, putative  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0625404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3312  general secretion pathway protein J, putative  92.38 
 
 		 210 aa  344  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2178  general secretion pathway protein J, putative  49.52 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02681  general secretion pathway protein J  35.1 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0551  general secretion pathway protein J  33.18 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.094871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1119  general secretory pathway protein J  31.34 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0861  general secretion pathway protein J  32.04 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0604467  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0774  general secretion pathway protein J  32.04 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.532398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0683  general secretion pathway protein J  26.54 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0756  general secretion pathway protein J  26.73 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2094  hypothetical protein  27.98 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0462903  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4155  general secretion pathway protein J  29.56 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.220352  hitchhiker  0.000742504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1304  general secretion pathway protein J  29.11 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2616  putative general secretion pathway protein J  28.93 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3004  putative general secretion pathway protein J  25.57 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 153 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2109  hypothetical protein  32.53 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>