66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3131 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  89.32 
 
 		 337 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  66.87 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  59.54 
 
 		 347 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  58.88 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  57.24 
 
 		 347 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  55.52 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  51.98 
 
 		 392 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  53.35 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  48.21 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  48.32 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  45.57 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.46 
 
 		 362 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  44.33 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  39.21 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  39.54 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  38.87 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  42.58 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.41 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  34.26 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  34.54 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  35.53 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30.96 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.99 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.21 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.62 
 
 		 391 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.93 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  27.24 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.47 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.11 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  27.54 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  25.28 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  26.14 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.62 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  25.73 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  27.5 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.5 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.67 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  31.18 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.69 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.14 
 
 		 433 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.33 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.25 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.73 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1231  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.53 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.279686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.04 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  27.17 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  28.81 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.55 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.81 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.81 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3069  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.31 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.117634  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  25.42 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.91 
 
 		 386 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.960119  normal  0.0627799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1330  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.91 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  0.523473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1170  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.91 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0188326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.18 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2558  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.78 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1847  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.78 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.54 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.98 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249127 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7179  acyl-CoA dehydrogenase  26.63 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.05 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  25.27 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>