26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1643 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  90.26 
 
 		 195 aa  358  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  97.44 
 
 		 195 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  87.69 
 
 		 195 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  88.21 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  88.21 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  87.69 
 
 		 195 aa  347  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  80 
 
 		 195 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  79.79 
 
 		 195 aa  253  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  41.62 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  41.76 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  35.09 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  33.14 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  34.22 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  30.81 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  28.57 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  25.84 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  25.23 
 
 		 146 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  27.27 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  28.02 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  26.83 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  28.03 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  24.86 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  30 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>