24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2393 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2393  NAD-dependent DNA ligase  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3865  hypothetical protein  46.15 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4113  hypothetical protein  34.67 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  decreased coverage  0.00587684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0663  NAD-dependent DNA ligase  30.81 
 
 		 312 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000015383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3053  BRCT domain protein  30.77 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2589  NAD-dependent DNA ligase  30.26 
 
 		 298 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0862  hypothetical protein  30.06 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.253306  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1077  NAD-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 301 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2687  NAD-dependent DNA ligase  29.74 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1827  NAD-dependent DNA ligase  30.61 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.17 
 
 		 2123 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.09 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  33.73 
 
 		 666 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  34.94 
 
 		 704 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  34.62 
 
 		 712 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0500  DNA ligase, NAD-dependent  36.71 
 
 		 670 aa  45.4  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.147098  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  32.58 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  39.06 
 
 		 942 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1699  DNA ligase (NAD+)  28.36 
 
 		 677 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.699894  normal  0.700726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  29.07 
 
 		 662 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.35 
 
 		 300 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1066  DNA ligase, NAD-dependent  30 
 
 		 709 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  31.33 
 
 		 663 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>