More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1954 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  87.78 
 
 
311 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  54.92 
 
 
325 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  54.79 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  55.74 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  54.46 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  47.38 
 
 
344 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  52.27 
 
 
329 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  49.51 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  50.16 
 
 
315 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  50.76 
 
 
325 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  44 
 
 
326 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  49.03 
 
 
322 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  45.4 
 
 
363 aa  268  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  49.68 
 
 
316 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  45.79 
 
 
348 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  42.81 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  50.33 
 
 
320 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  47.63 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  47.15 
 
 
345 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  44.95 
 
 
334 aa  255  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  47.47 
 
 
336 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  47.6 
 
 
323 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  44.78 
 
 
348 aa  246  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  41.4 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  41.4 
 
 
319 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  42.37 
 
 
325 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  49.52 
 
 
329 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  43.09 
 
 
313 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  42.76 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  42.76 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  43.41 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  42.76 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  42.43 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  45.78 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  41.99 
 
 
322 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  42.27 
 
 
333 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  34.39 
 
 
311 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  34.39 
 
 
311 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  35.49 
 
 
311 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.64 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.21 
 
 
316 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  27.27 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  26.25 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  26.25 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  26.25 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  26.25 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  26.32 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.32 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  26.25 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  25.99 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  26.62 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  26.32 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  29.63 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.95 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  30.48 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  29.5 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  26.82 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  27.13 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  28.68 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  25.35 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  25.4 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  27.92 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  25.5 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  26.53 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  27.51 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  27.51 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  27.51 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  27.51 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  27.17 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  25.85 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  27.14 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  29.53 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  27.14 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  27.14 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  27.14 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.55 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  27.13 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  26.77 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  26.77 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  26.77 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  27.51 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  27.33 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  26.77 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  22.33 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  27.36 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  29.01 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  30.56 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  25.64 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  28.32 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  26.77 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  26.19 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  28.37 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  27.51 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  28.72 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.59 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.26 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  27.46 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  28.47 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  26.76 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>