61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3714 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3714  muconolactone isomerase  100 
 
 		 96 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2205  muconolactone delta-isomerase  98.96 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2054  muconolactone Delta-isomerase  98.96 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2704  muconolactone delta-isomerase  94.79 
 
 		 96 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710381  normal  0.322993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2962  muconolactone delta-isomerase  89.58 
 
 		 96 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2326  muconolactone delta-isomerase  90.62 
 
 		 96 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32230  muconolactone delta-isomerase  86.46 
 
 		 96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2731  muconolactone delta-isomerase  85.42 
 
 		 96 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620744  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0198  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0229  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2568  muconolactone delta-isomerase 2  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2712  muconolactone delta-isomerase 2  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1570  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1373  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0988  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0483  muconolactone delta-isomerase  76.04 
 
 		 96 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5497  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3755  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3768  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4595  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2330  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3660  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125704  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2110  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4962  muconolactone delta-isomerase  70.83 
 
 		 96 aa  150  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4027  muconolactone delta-isomerase  72.92 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2151  muconolactone delta-isomerase  72.92 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1269  muconolactone delta-isomerase  61.05 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.477839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1362  muconolactone delta-isomerase  64.21 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12038  normal  0.0794783 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6586  muconolactone delta-isomerase  65.26 
 
 		 96 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.859863 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6301  muconolactone delta-isomerase  65.96 
 
 		 95 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.734539  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1426  muconolactone delta-isomerase  63.16 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3829  muconolactone delta-isomerase  60.42 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00966356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3236  muconolactone delta-isomerase  61.05 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.353793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1121  muconolactone Delta-isomerase  61.54 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0141  muconolactone delta-isomerase  60.44 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0159  muconolactone delta-isomerase  60.44 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0976  muconolactone Delta-isomerase  58.33 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1175  muconolactone delta-isomerase  55.79 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.986805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0331  muconolactone delta-isomerase  54.26 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19210  muconolactone delta-isomerase  60.44 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277055  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1359  muconolactone Delta-isomerase  56.99 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24655  normal  0.135289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2374  muconolactone delta-isomerase  58.24 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3938  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358097  normal  0.0505497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4677  muconolactone delta-isomerase  52.13 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629639  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1330  muconolactone delta-isomerase  58.24 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.223053  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1869  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1411  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.923457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3041  muconolactone Delta-isomerase  52.75 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1377  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1395  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0837  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4155  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1587  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0277807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1690  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4877  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.674817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1932  muconolactone delta-isomerase  52.75 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.414838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2118  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1502  muconolactone delta-isomerase  49.45 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1293  muconolactone delta-isomerase  53.76 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38380  muconolactone delta-isomerase  36.36 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2367  Muconolactone delta-isomerase  32.95 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0232225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>