62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3660 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3660  muconolactone delta-isomerase  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125704  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2330  muconolactone delta-isomerase  97.92 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3755  muconolactone delta-isomerase  97.92 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3768  muconolactone delta-isomerase  97.92 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5497  muconolactone delta-isomerase  97.92 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4595  muconolactone delta-isomerase  97.92 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4962  muconolactone delta-isomerase  95.83 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0483  muconolactone delta-isomerase  79.17 
 
 		 96 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0198  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0229  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2568  muconolactone delta-isomerase 2  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2712  muconolactone delta-isomerase 2  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1570  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1373  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0988  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2151  muconolactone delta-isomerase  78.12 
 
 		 96 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2110  muconolactone delta-isomerase  77.08 
 
 		 96 aa  160  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2054  muconolactone Delta-isomerase  72.92 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2205  muconolactone delta-isomerase  72.92 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3714  muconolactone isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32230  muconolactone delta-isomerase  68.75 
 
 		 96 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2962  muconolactone delta-isomerase  69.79 
 
 		 96 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2731  muconolactone delta-isomerase  67.71 
 
 		 96 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2704  muconolactone delta-isomerase  69.79 
 
 		 96 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710381  normal  0.322993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2326  muconolactone delta-isomerase  67.71 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4027  muconolactone delta-isomerase  68.75 
 
 		 96 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1269  muconolactone delta-isomerase  62.11 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.477839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1426  muconolactone delta-isomerase  63.16 
 
 		 96 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3236  muconolactone delta-isomerase  62.11 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.353793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1362  muconolactone delta-isomerase  62.11 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12038  normal  0.0794783 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3829  muconolactone delta-isomerase  59.38 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00966356  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6586  muconolactone delta-isomerase  60 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.859863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1121  muconolactone Delta-isomerase  61.54 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6301  muconolactone delta-isomerase  58.51 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.734539  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4677  muconolactone delta-isomerase  60.44 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629639  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1175  muconolactone delta-isomerase  55.79 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.986805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0976  muconolactone Delta-isomerase  56.25 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3041  muconolactone Delta-isomerase  54.35 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19210  muconolactone delta-isomerase  58.24 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277055  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1330  muconolactone delta-isomerase  58.24 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.223053  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3938  muconolactone delta-isomerase  56.04 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358097  normal  0.0505497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1411  muconolactone delta-isomerase  55.43 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.923457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0331  muconolactone delta-isomerase  53.19 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1377  muconolactone delta-isomerase  55.43 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1395  muconolactone delta-isomerase  55.43 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2374  muconolactone delta-isomerase  56.04 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0141  muconolactone delta-isomerase  52.75 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1690  muconolactone delta-isomerase  55.43 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0159  muconolactone delta-isomerase  52.75 
 
 		 98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4155  muconolactone delta-isomerase  53.85 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0837  muconolactone delta-isomerase  53.26 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1869  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1359  muconolactone Delta-isomerase  54.35 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24655  normal  0.135289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4877  muconolactone delta-isomerase  53.26 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.674817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1587  muconolactone delta-isomerase  53.85 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0277807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1502  muconolactone delta-isomerase  49.45 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1932  muconolactone delta-isomerase  48.35 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.414838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2118  muconolactone delta-isomerase  49.45 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1293  muconolactone delta-isomerase  49.46 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38380  muconolactone delta-isomerase  32.95 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2367  Muconolactone delta-isomerase  36.36 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0232225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10321  muconolactone isomerase  28.26 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662536  normal  0.852606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>