61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2962 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2962  muconolactone delta-isomerase  100 
 
 		 96 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2205  muconolactone delta-isomerase  90.62 
 
 		 96 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2054  muconolactone Delta-isomerase  90.62 
 
 		 96 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3714  muconolactone isomerase  89.58 
 
 		 96 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2704  muconolactone delta-isomerase  89.58 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710381  normal  0.322993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2326  muconolactone delta-isomerase  87.5 
 
 		 96 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2731  muconolactone delta-isomerase  84.38 
 
 		 96 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32230  muconolactone delta-isomerase  83.33 
 
 		 96 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0198  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0229  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2568  muconolactone delta-isomerase 2  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2712  muconolactone delta-isomerase 2  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1570  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1373  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0988  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2110  muconolactone delta-isomerase  73.96 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0483  muconolactone delta-isomerase  71.88 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2151  muconolactone delta-isomerase  72.92 
 
 		 96 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2330  muconolactone delta-isomerase  69.79 
 
 		 96 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3660  muconolactone delta-isomerase  69.79 
 
 		 96 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125704  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5497  muconolactone delta-isomerase  68.75 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4027  muconolactone delta-isomerase  69.79 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3755  muconolactone delta-isomerase  68.75 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4595  muconolactone delta-isomerase  68.75 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3768  muconolactone delta-isomerase  68.75 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4962  muconolactone delta-isomerase  67.71 
 
 		 96 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6586  muconolactone delta-isomerase  65.26 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.859863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1269  muconolactone delta-isomerase  58.95 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.477839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6301  muconolactone delta-isomerase  64.89 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.734539  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3236  muconolactone delta-isomerase  62.11 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.353793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1362  muconolactone delta-isomerase  63.16 
 
 		 96 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12038  normal  0.0794783 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3829  muconolactone delta-isomerase  59.38 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00966356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1426  muconolactone delta-isomerase  62.11 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0976  muconolactone Delta-isomerase  57.29 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0331  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1121  muconolactone Delta-isomerase  57.14 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0141  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0159  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 98 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1175  muconolactone delta-isomerase  53.68 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.986805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19210  muconolactone delta-isomerase  58.24 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277055  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1359  muconolactone Delta-isomerase  55.91 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24655  normal  0.135289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1869  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3041  muconolactone Delta-isomerase  50.55 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1690  muconolactone delta-isomerase  57.14 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2374  muconolactone delta-isomerase  56.04 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4155  muconolactone delta-isomerase  53.76 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2118  muconolactone delta-isomerase  52.75 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1330  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.223053  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1587  muconolactone delta-isomerase  54.95 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0277807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4677  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629639  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3938  muconolactone delta-isomerase  52.75 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358097  normal  0.0505497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1932  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.414838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4877  muconolactone delta-isomerase  53.85 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.674817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0837  muconolactone delta-isomerase  51.61 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1411  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.923457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1377  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1395  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1502  muconolactone delta-isomerase  51.65 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1293  muconolactone delta-isomerase  51.61 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38380  muconolactone delta-isomerase  32.95 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2367  Muconolactone delta-isomerase  32.95 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0232225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>