73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2415 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2415  acetyltransferase  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
165 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.838231  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2052  GCN5-related N-acetyltransferase  89.35 
 
 
170 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.803616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  75.78 
 
 
166 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3098  GCN5-related N-acetyltransferase  55.62 
 
 
164 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3260  acetyltransferase, GNAT family  53.75 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366383  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0646  acetyltransferase, gnat family  35.5 
 
 
169 aa  103  1e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.46406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2036  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
174 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  27.36 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  24.76 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
169 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
157 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  52.94 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.19 
 
 
322 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
169 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  32 
 
 
184 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  31.91 
 
 
319 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5585  acetyltransferase protein  36.05 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155048  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  31.91 
 
 
319 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  20.36 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0426  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
170 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1103  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  38.71 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  32.91 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  32.91 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  32.91 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  32.91 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  32.91 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  38.71 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.19 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  37.1 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  37.1 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  37.1 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0870  acetyltransferase  25.17 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0427112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  33.78 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2792  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  37.1 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3275  acetyltransferase  27.85 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  24.6 
 
 
160 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
160 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3300  GCN5-related N-acetyltransferase  22.37 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0928337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
163 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  26.73 
 
 
158 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0989  acetyltransferase  25 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137577  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1586  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
172 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000828974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
167 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
177 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  22.86 
 
 
161 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0971  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
157 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  31.07 
 
 
208 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2930  acetyltransferase  31.07 
 
 
170 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
172 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  36 
 
 
238 aa  41.6  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>