41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0650 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 36 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  91.67 
 
 		 511 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  91.67 
 
 		 511 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  91.67 
 
 		 511 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  91.67 
 
 		 511 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  91.67 
 
 		 511 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  88.89 
 
 		 511 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  88.89 
 
 		 511 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  77.78 
 
 		 517 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  77.78 
 
 		 519 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  77.78 
 
 		 519 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  77.14 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  77.14 
 
 		 506 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  77.14 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  72.22 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  79.41 
 
 		 511 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  80.56 
 
 		 511 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  69.44 
 
 		 509 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  69.44 
 
 		 509 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  69.44 
 
 		 509 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  69.44 
 
 		 509 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  69.44 
 
 		 509 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  69.44 
 
 		 509 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  66.67 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  66.67 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  66.67 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0284  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.750313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  65.71 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  65.71 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  65.71 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  61.11 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6598  transposase IS66 family  68.57 
 
 		 48 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  62.86 
 
 		 528 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4702  transposase IS66  62.86 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0921024 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4638  transposase IS66  62.86 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  62.86 
 
 		 517 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0369  hypothetical protein  68.75 
 
 		 53 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.902852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6390  transposase IS66 family  57.14 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0068  putative transposase, truncation  58.06 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  52.94 
 
 		 515 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4451  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601744  normal  0.0168193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>