48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1546 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  95.88 
 
 		 170 aa  323  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  95.88 
 
 		 170 aa  322  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  92.94 
 
 		 170 aa  313  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  62.94 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  62.94 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  61.35 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  56.33 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  48.08 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  45.51 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  36.05 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  34.68 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  34.68 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  34.12 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.62 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  34.3 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.06 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  25.16 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.48 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  26.71 
 
 		 448 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  28.74 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  25.16 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  27.16 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  24.53 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 		 165 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.6 
 
 		 188 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.57 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>