26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1517 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  97.98 
 
 
297 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  61.95 
 
 
296 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  66.43 
 
 
300 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  69.15 
 
 
300 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  66.09 
 
 
307 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  52.98 
 
 
277 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  50.88 
 
 
273 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  51.23 
 
 
273 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  50.18 
 
 
273 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  44.4 
 
 
278 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.09 
 
 
248 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.7 
 
 
256 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  36.47 
 
 
274 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.15 
 
 
256 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.76 
 
 
256 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  36.36 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.08 
 
 
286 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.32 
 
 
250 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  31.69 
 
 
253 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.59 
 
 
238 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  27.2 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.17 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.51 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.29 
 
 
405 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  29.51 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>