164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0339 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  96.92 
 
 		 65 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  89.23 
 
 		 65 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  78.79 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  81.54 
 
 		 64 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  81.54 
 
 		 64 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  77.27 
 
 		 64 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 64 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  70.31 
 
 		 64 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  70.31 
 
 		 64 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  70.31 
 
 		 64 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  69.35 
 
 		 62 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  80.36 
 
 		 55 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  60 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  70.97 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  56.72 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  59.09 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  55.38 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  55.22 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  53.97 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  56.06 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  53.73 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  52.24 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  54.41 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  46.15 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  43.08 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  52.46 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  49.15 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  49.15 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  46.15 
 
 		 54 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  49.12 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  49.15 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  47.76 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  60.61 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  47.54 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 52 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  47.76 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0975  50S ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262128  normal  0.195912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  59.09 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  46.03 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  46.77 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  43.55 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  46.27 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  60.53 
 
 		 43 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  63.64 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  45.76 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  46.88 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  45.76 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  46.88 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  40.62 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>