245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80440 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_80440  aspartate aminotransferase  100 
 
 
439 aa  905    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01993  aspartate transaminase, mitochondrial (Eurofung)  46 
 
 
429 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.303718 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00950  Aspartate aminotransferase, mitochondrial precursor, putative  46.1 
 
 
453 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23871  aspartate aminotransferase  41.91 
 
 
426 aa  362  6e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00360  aspartate transaminase, putative  42.44 
 
 
413 aa  349  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0699842  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31597  predicted protein  42.09 
 
 
399 aa  345  8e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.955549  normal  0.45996 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23059  aspartate transaminase  41.52 
 
 
435 aa  332  9e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  39.27 
 
 
398 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  38.14 
 
 
402 aa  312  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
398 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  38.97 
 
 
398 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66059  aspartate aminotransferase  41.32 
 
 
415 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  40.1 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  41.15 
 
 
396 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  39.12 
 
 
398 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  39.95 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06048  aspartate transaminase (Eurofung)  38.85 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.175084  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  40.9 
 
 
396 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  36.52 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  40.4 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  40.65 
 
 
396 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  40.4 
 
 
396 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  41.4 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  40.24 
 
 
398 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  37.75 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  38.24 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  37.68 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  38.73 
 
 
398 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  38.24 
 
 
397 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  37.99 
 
 
397 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
400 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  37.01 
 
 
398 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  37.01 
 
 
398 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
397 aa  299  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  39.71 
 
 
398 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  37.65 
 
 
399 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  39.9 
 
 
396 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  37.99 
 
 
397 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  36.76 
 
 
398 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  38.73 
 
 
397 aa  299  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  39.22 
 
 
397 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  37.75 
 
 
397 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  38.97 
 
 
397 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  37.99 
 
 
397 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  37.99 
 
 
397 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 
398 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  39.22 
 
 
398 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  36.76 
 
 
398 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
397 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 
396 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
397 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  37.11 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  37.25 
 
 
397 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 
396 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 
396 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 
396 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 
396 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 
396 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  37.94 
 
 
399 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  38.65 
 
 
396 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  38.18 
 
 
396 aa  292  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  37.94 
 
 
399 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  37.9 
 
 
399 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  36.98 
 
 
399 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  39.75 
 
 
396 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  36.98 
 
 
402 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  36.87 
 
 
399 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  35.85 
 
 
401 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  34.56 
 
 
400 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  38.67 
 
 
401 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  38.9 
 
 
396 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
400 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
400 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3088  aromatic amino acid aminotransferase  37.04 
 
 
395 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.117971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  37.01 
 
 
398 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  39.51 
 
 
396 aa  289  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  37.75 
 
 
397 aa  289  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  37.01 
 
 
398 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  37.01 
 
 
399 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  37.32 
 
 
399 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  38.26 
 
 
401 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  37.32 
 
 
396 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  37.44 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  39.26 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  38.4 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  37.44 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>