22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72031 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  100 
 
 		 847 aa  1752    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.585457 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  29.81 
 
 		 884 aa  313  6.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  25.9 
 
 		 772 aa  177  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  25.72 
 
 		 725 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  29.6 
 
 		 800 aa  165  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  29.6 
 
 		 911 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  24.7 
 
 		 727 aa  156  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  24.57 
 
 		 678 aa  151  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  25.41 
 
 		 734 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  24.72 
 
 		 751 aa  147  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  24.38 
 
 		 743 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  25.18 
 
 		 712 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  25.27 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  21.81 
 
 		 896 aa  90.1  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.21 
 
 		 497 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  28.45 
 
 		 512 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.57 
 
 		 526 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.1 
 
 		 598 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  26.9 
 
 		 458 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 633 aa  44.3  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  35.9 
 
 		 568 aa  44.3  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.46 
 
 		 334 aa  44.3  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>