55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50873 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  100 
 
 
146 aa  302  8.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  62.2 
 
 
1211 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  46.91 
 
 
880 aa  71.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  58.93 
 
 
1150 aa  69.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  55.36 
 
 
1195 aa  65.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  50 
 
 
1009 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  43.1 
 
 
857 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  48.08 
 
 
580 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.301419 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  58.7 
 
 
313 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  50.85 
 
 
1049 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.119069 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  44.93 
 
 
991 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  32.04 
 
 
692 aa  54.7  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  50.91 
 
 
416 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  49.02 
 
 
864 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  50.91 
 
 
737 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  44.83 
 
 
583 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  43.75 
 
 
596 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  41.94 
 
 
913 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  40.68 
 
 
746 aa  50.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  32.17 
 
 
1121 aa  50.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  39.66 
 
 
781 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  36.99 
 
 
650 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  44.44 
 
 
446 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  49.02 
 
 
993 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  30.39 
 
 
519 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  46.3 
 
 
579 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  40.38 
 
 
730 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872321 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  35.2 
 
 
662 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  42.86 
 
 
1078 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  41.67 
 
 
1161 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  36.92 
 
 
730 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  40.3 
 
 
333 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  38.03 
 
 
354 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0534008 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  40.48 
 
 
250 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54178  C2H2 zinc finger protein  34.67 
 
 
1158 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  43.86 
 
 
432 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11197  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  51.11 
 
 
865 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 
851 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06060  expressed protein  36 
 
 
477 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  40.91 
 
 
667 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
NC_006686  CND01440  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 
453 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  44.44 
 
 
712 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  39.62 
 
 
675 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  40.58 
 
 
815 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  37.1 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
1089 aa  42  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  34.72 
 
 
741 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  41.67 
 
 
421 aa  42  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  35.19 
 
 
513 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  38.89 
 
 
626 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  36.92 
 
 
1003 aa  41.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00390  expressed protein  44.44 
 
 
691 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  33.33 
 
 
465 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12306 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04340  transcription factor iiia, putative  37.29 
 
 
544 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235343  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00709  Putative uncharacterized proteinSILG ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFH1]  36.36 
 
 
703 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.66295  normal  0.944601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>