19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28888 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  100 
 
 		 321 aa  649    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  28.21 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02090  expressed protein  24.8 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.841584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.97 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05409  conserved hypothetical protein  25.27 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.172063 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  27.17 
 
 		 241 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  27.69 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.28 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  25.94 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  24.89 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.18 
 
 		 491 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>