18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47753 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  100 
 
 
700 aa  1445    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  25.14 
 
 
407 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47751  predicted protein  58.7 
 
 
760 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  32.84 
 
 
334 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47755  predicted protein  51.02 
 
 
749 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.373674  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  34.25 
 
 
442 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  37.84 
 
 
75 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  28.04 
 
 
531 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  60 
 
 
143 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  31.75 
 
 
397 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  32.47 
 
 
67 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  32.43 
 
 
220 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  50 
 
 
295 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  31.91 
 
 
568 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  31.94 
 
 
439 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  30.56 
 
 
724 aa  44.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  33.02 
 
 
376 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  30.56 
 
 
611 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>