More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0523 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0523  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  1028    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0931485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2665  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 
504 aa  714    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3214  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.33 
 
 
503 aa  715    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0407  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
506 aa  714    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0111575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0394  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.62 
 
 
500 aa  749    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01810  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.05 
 
 
505 aa  655    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.39 
 
 
507 aa  649    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.45 
 
 
506 aa  665    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.725577  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.69 
 
 
497 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000239611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.49 
 
 
485 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.14 
 
 
488 aa  276  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.15 
 
 
504 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65804  predicted protein  35.63 
 
 
524 aa  269  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0114007  normal  0.2488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.25 
 
 
484 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 
508 aa  266  8e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
503 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
486 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.45 
 
 
483 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
482 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
482 aa  259  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04240  IMP dehydrogenase, putative  35.45 
 
 
544 aa  258  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0375303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.34 
 
 
487 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.97 
 
 
483 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.07 
 
 
488 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  35.73 
 
 
490 aa  258  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
504 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
507 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
488 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.46 
 
 
488 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
488 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
494 aa  256  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
488 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  35.53 
 
 
490 aa  256  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
488 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.01 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.4 
 
 
486 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.63 
 
 
486 aa  253  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  35.39 
 
 
484 aa  253  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
493 aa  252  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
488 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.84 
 
 
490 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
488 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.26 
 
 
485 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
488 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
488 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
488 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.22 
 
 
492 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.16 
 
 
488 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31718  predicted protein  37.75 
 
 
468 aa  249  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.160049  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.22 
 
 
497 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
488 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 
492 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
490 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.41 
 
 
498 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.41 
 
 
489 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.09 
 
 
489 aa  248  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.07 
 
 
514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.4 
 
 
496 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.08 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.42 
 
 
489 aa  246  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.36 
 
 
485 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.54 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.9 
 
 
485 aa  244  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.41 
 
 
496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
485 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
487 aa  243  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
490 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
487 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
500 aa  242  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
487 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
486 aa  242  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
493 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
500 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  33.94 
 
 
486 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
487 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.22 
 
 
490 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.82 
 
 
485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.84 
 
 
488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
487 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
487 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.41 
 
 
516 aa  240  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
496 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.65 
 
 
490 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.02 
 
 
488 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.43 
 
 
497 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.98 
 
 
498 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  33.2 
 
 
493 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
491 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
487 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.42 
 
 
490 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
487 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
487 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
484 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
482 aa  237  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33 
 
 
488 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>