61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0707 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0707  50S ribosomal protein L25  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0736  50S ribosomal protein L25  95.37 
 
 		 108 aa  216  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4741  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  61.46 
 
 		 198 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3283  50S ribosomal protein L25  54.08 
 
 		 102 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228774  normal  0.044405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3523  Ribosomal protein L25-like protein  58.51 
 
 		 98 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2054  50S ribosomal protein L25  56.38 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2531  50S ribosomal protein L25  54.84 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2818  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  30.69 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1635  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.42 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1454  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.97 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0078  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.71 
 
 		 208 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.514827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1041  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  37.25 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000685221  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1803  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  39.19 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2145  ribosomal protein L25  39.19 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1232  ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)  32.97 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0660333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1074  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  37.97 
 
 		 213 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.87719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3628  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.52 
 
 		 200 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0673  ribosomal protein L25  31.18 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3653  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00224871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0346  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  34.34 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.246778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4253  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.06 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4339  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.06 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.583679  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1169  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  36.47 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4632  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.06 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.570294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0943  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.43 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0174  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.118362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1247  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  38.46 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4754  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.78 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0446761  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0142  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.76 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0755  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.29 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1127  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.77 
 
 		 203 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1255  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.57 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0112438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0765  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.12 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4787  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.14 
 
 		 218 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1103  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.63 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2257  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  27.88 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4462  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.73 
 
 		 198 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0047  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.29 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0426  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.95 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122044  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0092  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.41 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1939  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.17 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0727  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.59 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912849  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0394  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.71 
 
 		 206 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.761444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0536  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.24 
 
 		 217 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0706274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0721  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.1 
 
 		 217 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0655  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  33.01 
 
 		 197 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0528  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  26.42 
 
 		 212 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0523  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.24 
 
 		 217 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1377  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  25.77 
 
 		 207 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448782 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1057  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  29.79 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0348708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0677  50S ribosomal protein L25P  27.18 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0070  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  25.47 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.704852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3209  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  29.76 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0249  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.49 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0276  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.49 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1818  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.33 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1539  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  30.86 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2003  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.87 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000475903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0045  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.29 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41530  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.4 
 
 		 198 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0182  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.7 
 
 		 185 aa  40  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.504227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>