17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3750 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  100 
 
 
162 aa  327  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  64.29 
 
 
173 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  64.29 
 
 
173 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  57.14 
 
 
172 aa  170  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  61.9 
 
 
165 aa  153  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  57.34 
 
 
164 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  54.17 
 
 
165 aa  133  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  55.22 
 
 
140 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  49.55 
 
 
145 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  53.54 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  40.54 
 
 
127 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  35.14 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  23.64 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.43 
 
 
179 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  28.85 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  23.17 
 
 
182 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>