14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2650 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2650  sensor protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  47.74 
 
 		 619 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  41.15 
 
 		 633 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  27.56 
 
 		 536 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 601 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  23.16 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  31.25 
 
 		 418 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 680 aa  45.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  35 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  29.7 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  30 
 
 		 683 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 401 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 610 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 682 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>