16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0487 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0487  TspO and MBR like protein  100 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0788  TspO and MBR related proteins  56.41 
 
 
157 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3225  TspO and MBR like protein  63.69 
 
 
157 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424853  normal  0.126633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0789  TspO and MBR related proteins  55.13 
 
 
157 aa  173  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1613  TspO and MBR like protein  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2287  TspO and MBR like proteins  49.68 
 
 
157 aa  147  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2044  TspO and MBR related proteins  41.94 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0850027  normal  0.66008 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  26.49 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  27.27 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  27.13 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  27.91 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  23.87 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  27.91 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  27.46 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  23.85 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  27.97 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>