29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2044 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2044  TspO and MBR related proteins  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0850027  normal  0.66008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0487  TspO and MBR like protein  41.94 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0789  TspO and MBR related proteins  41.56 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0788  TspO and MBR related proteins  41.94 
 
 
157 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1613  TspO and MBR like protein  37.25 
 
 
157 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3225  TspO and MBR like protein  42.21 
 
 
157 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424853  normal  0.126633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2287  TspO and MBR like proteins  40.94 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  31.43 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  26.28 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  26.32 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  26.32 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  24.36 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  25.64 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  25.64 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  25.64 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  29.46 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  23.03 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  30 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  30.23 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  25.64 
 
 
183 aa  44.3  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  27.52 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  27.56 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  28 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  29.08 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  29.46 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  29.01 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  24.62 
 
 
184 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  25.45 
 
 
188 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  28 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>