25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0368 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  63.28 
 
 
147 aa  174  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  60.61 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  60.8 
 
 
154 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1785  hypothetical protein  38.52 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0273251  normal  0.172836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  26.98 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.01 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  26.32 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  28.91 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  27.56 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  27.34 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  28.8 
 
 
355 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  26.15 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  28.57 
 
 
356 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  28.12 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  26.15 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  26.19 
 
 
349 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  26.45 
 
 
360 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  27.19 
 
 
355 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  25.81 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  25.81 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.22 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>