20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0643 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  271  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  92.97 
 
 		 128 aa  256  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  47.54 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  34.4 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.59 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  29.77 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  29.77 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  36.46 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  31.4 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  27.87 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>