23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22571 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22571  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  64.96 
 
 
211 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  64.96 
 
 
211 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16951  site-specific recombinase  38.39 
 
 
240 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.378024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17071  site-specific recombinase  41.96 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17191  site-specific recombinase  41.59 
 
 
224 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1607  site-specific recombinase  40.71 
 
 
224 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138506  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.65 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.97 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  34.88 
 
 
207 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  31.58 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  31.07 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.44 
 
 
195 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  30.48 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  31.19 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  28.83 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  28.83 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  28.83 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04811  DNA invertase  31.03 
 
 
209 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  30.36 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  28.04 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  33.33 
 
 
176 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>