75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11571 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  80.56 
 
 
370 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  80.28 
 
 
370 aa  610  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  77.97 
 
 
349 aa  567  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  77.97 
 
 
349 aa  567  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  74.37 
 
 
351 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  74.37 
 
 
351 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  71.47 
 
 
354 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  71.47 
 
 
354 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  69.54 
 
 
362 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  74 
 
 
349 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  69.54 
 
 
362 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  69.65 
 
 
365 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  70.49 
 
 
355 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  68.8 
 
 
352 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  68.42 
 
 
349 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  68.7 
 
 
349 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  67.22 
 
 
352 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  66.3 
 
 
351 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  65.01 
 
 
352 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  65.01 
 
 
352 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  65.01 
 
 
352 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  57.73 
 
 
352 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  57.78 
 
 
352 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  57.5 
 
 
352 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  57.78 
 
 
352 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  57.22 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  56.23 
 
 
350 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  57.5 
 
 
352 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  56.94 
 
 
352 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  57.06 
 
 
368 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  50.97 
 
 
359 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  50.28 
 
 
345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  42.86 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  42.05 
 
 
344 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  41.76 
 
 
342 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  42.37 
 
 
342 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  33.62 
 
 
343 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  32.41 
 
 
522 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  33.23 
 
 
368 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  33.1 
 
 
460 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  33.1 
 
 
460 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.75 
 
 
460 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.75 
 
 
460 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.75 
 
 
460 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.87 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.47 
 
 
459 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.29 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.87 
 
 
459 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.63 
 
 
461 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.13 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.13 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  31.01 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  33.92 
 
 
473 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  31.82 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  31.82 
 
 
459 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.38 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  31.47 
 
 
462 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  23.91 
 
 
507 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  23.84 
 
 
507 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  23.55 
 
 
507 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  23.55 
 
 
507 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  27.84 
 
 
519 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  37.31 
 
 
509 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.64 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.7 
 
 
519 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.33 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  35.06 
 
 
510 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.84 
 
 
510 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  31.73 
 
 
508 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.33 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  35.82 
 
 
509 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  35.06 
 
 
508 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  35.06 
 
 
508 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  35.06 
 
 
508 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>