More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2416 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  58.54 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  57.32 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  59.76 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  65 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  60.49 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  55.29 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>