19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2060 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 475 aa  951    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  30.64 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  28.12 
 
 		 610 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  27.64 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  25.57 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  26.46 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  24.09 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  22.15 
 
 		 559 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4037  phosphate-selective porin O and P  26.37 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  30.41 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  23.35 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  24.22 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  26.37 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  24.07 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_002950  PG1382  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0246633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  25.46 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  22.74 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  31.21 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>