225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2001 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2001  xylanase  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  61.67 
 
 
301 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  44.67 
 
 
333 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  42.39 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  41.16 
 
 
286 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  36 
 
 
333 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  35.26 
 
 
318 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  37.97 
 
 
308 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  45.9 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  38.14 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  40.78 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  39.36 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  35.94 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  36.88 
 
 
306 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  36.3 
 
 
308 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  38.97 
 
 
310 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  38.89 
 
 
326 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  36.83 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  38.78 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  37.46 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  41.2 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.8 
 
 
326 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.8 
 
 
417 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  39.53 
 
 
324 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.8 
 
 
404 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  37.8 
 
 
326 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  38.44 
 
 
342 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  38.32 
 
 
328 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  42.74 
 
 
301 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  36.54 
 
 
303 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  35.37 
 
 
301 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  38.64 
 
 
342 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  42.41 
 
 
337 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  38.03 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  38.65 
 
 
314 aa  165  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  38.82 
 
 
319 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  39.26 
 
 
353 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  35.91 
 
 
333 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  37.89 
 
 
337 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  36.33 
 
 
327 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  34.36 
 
 
323 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  34.59 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  36.11 
 
 
289 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  36.27 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  38.43 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  36.95 
 
 
339 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  38 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  34.41 
 
 
291 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  29.43 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  31.29 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  32.89 
 
 
308 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  37.66 
 
 
258 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  36.75 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  31.79 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  35.42 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  30.45 
 
 
317 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  31.95 
 
 
277 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  32.61 
 
 
325 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  31.66 
 
 
272 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  29.82 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  33.18 
 
 
255 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  29.11 
 
 
334 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  29.29 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  30.66 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  30.98 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  30.47 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  27.43 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  29.46 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.64 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  25.63 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  29.21 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.51 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.51 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.06 
 
 
344 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  28.64 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  29.02 
 
 
358 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  38.61 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.47 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  25.73 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2556  carboxylesterase  28.19 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.19 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.26 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  28.45 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  26.11 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1004  heroin esterase  27.47 
 
 
317 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.34 
 
 
420 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.32 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0735  esterase  26.42 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1005  lipase  26.42 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.50865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.06 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  30.81 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3254  lipase  27.35 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0525665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  30 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  27.75 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.08 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.76 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.84 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.25 
 
 
691 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  30.14 
 
 
631 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>