26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1927 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  100 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  46.57 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  41.45 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  42.7 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  39.07 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  41.09 
 
 		 288 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  38.32 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.95 
 
 		 445 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  30.58 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.74 
 
 		 330 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  27.44 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  39.52 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  38.71 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  31.37 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  26.64 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  31.46 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  31.46 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.75 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  28.76 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  26.85 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.75 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.75 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.65 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30 
 
 		 526 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.52 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>