44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0996 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0996  methyltransferase type 12  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0100468  hitchhiker  0.00269187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2850  Methyltransferase type 12  29.67 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852328  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1748  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5007  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0563553  hitchhiker  0.00499948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.42 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2224  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.54 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.56 
 
 
237 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.84 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.72 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  24.81 
 
 
223 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  41.25 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.58 
 
 
269 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.87 
 
 
205 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
274 aa  45.1  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.66 
 
 
250 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.85 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  37.66 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  50 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  40 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  40 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.73 
 
 
271 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  33.62 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  33.73 
 
 
395 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.96 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  29.46 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0784  small-molecule methyltransferase IraA  33.33 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0813  small-molecule methyltransferase IraA  33.33 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 
329 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
333 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  33.87 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  32.2 
 
 
307 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.24 
 
 
260 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.44 
 
 
258 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>