15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32976 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  100 
 
 
1194 aa  2453    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  34.15 
 
 
667 aa  285  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  36.5 
 
 
1717 aa  255  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 
1858 aa  244  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  31.2 
 
 
550 aa  234  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  38.71 
 
 
844 aa  223  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  27.92 
 
 
1544 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  27.92 
 
 
1544 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  39.09 
 
 
1131 aa  145  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  26.63 
 
 
654 aa  142  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  36 
 
 
1405 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  35.24 
 
 
857 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  27.52 
 
 
1699 aa  92.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134304 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25099  predicted protein  28.92 
 
 
729 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26838  predicted protein  38.67 
 
 
255 aa  45.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.05817  normal  0.063601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>