19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30347 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  100 
 
 
458 aa  947    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.192095 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  28.12 
 
 
357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  24.78 
 
 
700 aa  98.2  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  25.79 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  38.74 
 
 
898 aa  93.2  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80446  protein involved in Golgi retention and vacuolar sorting  39.66 
 
 
684 aa  86.7  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.914331  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  25 
 
 
392 aa  83.2  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27578  predicted protein  21.81 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.57601  normal  0.151799 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  37.4 
 
 
142 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  35.43 
 
 
158 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  32.8 
 
 
493 aa  67  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  40.22 
 
 
738 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547553 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  41.76 
 
 
612 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  32.76 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  29.77 
 
 
591 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.397245 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01377  intermediate filament, regulator of G-protein signaling (Eurofung)  28.33 
 
 
1224 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33114  predicted protein  27.43 
 
 
720 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.157822 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03560  hypothetical protein  29.46 
 
 
638 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>