229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2330 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  245  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  245  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  99.19 
 
 
124 aa  243  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  98.17 
 
 
109 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  83.74 
 
 
124 aa  209  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  83.74 
 
 
124 aa  209  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  83.74 
 
 
124 aa  209  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  83.61 
 
 
124 aa  205  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  86.21 
 
 
121 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  84.17 
 
 
133 aa  202  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  79.69 
 
 
129 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  81.97 
 
 
124 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  81.97 
 
 
124 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  80.17 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  73.17 
 
 
124 aa  189  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  73.17 
 
 
124 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  73.17 
 
 
124 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 
124 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  73.04 
 
 
125 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  74.75 
 
 
99 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  82.35 
 
 
94 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  66.15 
 
 
71 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  80.36 
 
 
57 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 
57 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  75 
 
 
53 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  75.47 
 
 
64 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  40.45 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  33.78 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  30.11 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  32.63 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  32.63 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  78.12 
 
 
43 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  26.53 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  26.53 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  26.53 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  32.04 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  32.04 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  27.37 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  26.53 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  28.42 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  34.12 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  34.25 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  31.76 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  25.51 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  31.76 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  25.51 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
382 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  28.87 
 
 
382 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  26.88 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  27.84 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  25.51 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  26.88 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  28.42 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  28.42 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  28.42 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  28.42 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>