30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2088 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1710    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  75.72 
 
 		 847 aa  1278    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  60.58 
 
 		 851 aa  982    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  67.85 
 
 		 850 aa  1181    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  34.66 
 
 		 835 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  34.49 
 
 		 841 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  35.64 
 
 		 822 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  34.34 
 
 		 831 aa  396  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  31.76 
 
 		 823 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  32.7 
 
 		 826 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  30.84 
 
 		 830 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  32.75 
 
 		 830 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  34.38 
 
 		 789 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  31.56 
 
 		 829 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  32.72 
 
 		 846 aa  343  9e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  32.13 
 
 		 849 aa  336  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  31.27 
 
 		 847 aa  333  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  31.61 
 
 		 845 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  31.04 
 
 		 847 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  32.98 
 
 		 835 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  30.85 
 
 		 825 aa  323  8e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  31.97 
 
 		 814 aa  323  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  36.76 
 
 		 376 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  28.65 
 
 		 472 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  25.21 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  22.86 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  21.08 
 
 		 869 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  28 
 
 		 570 aa  56.6  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  20.98 
 
 		 821 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.29 
 
 		 827 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>