17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0824 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  206  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  36.21 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  48.94 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  37.25 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  37.25 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  44.68 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  40.43 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  40 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  41.67 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7467  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  35.29 
 
 		 65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>