28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0442 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  33.63 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  31.47 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  26.85 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  32.74 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  32.74 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  32.74 
 
 		 329 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  29.88 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  22.82 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  33.33 
 
 		 540 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  22.53 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  29.03 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  31.01 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  31.3 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  29.2 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1359  NERD domain protein  27.94 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  30.09 
 
 		 329 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  27.39 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  34.65 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  23.61 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  25.81 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  23.61 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  34.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  29.73 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  28.85 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3660  NERD domain-containing protein  22.56 
 
 		 323 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>