20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3954 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  46.49 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  46.49 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  46.49 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  44.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  43.97 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  41.38 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  42.59 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  40.65 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  40.54 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  38.74 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  35 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  24.59 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  29.7 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  33.64 
 
 		 265 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  30.89 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  21.19 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>