25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2687 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  100 
 
 		 223 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2264  YhhN family protein  37.56 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.410699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  30.2 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  34.38 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  34.81 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  34.13 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  30.34 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  34.09 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  34.1 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  34.1 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  32.41 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3339  YhhN family protein  38.13 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  35.42 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  30.89 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  33.09 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  31.22 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  31.47 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  31.41 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  27.49 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  26.67 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  32.74 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  31.28 
 
 		 214 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  36.75 
 
 		 236 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  31.82 
 
 		 216 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  34.78 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>